當初改廁工作中，由于人力、物力有限，為了完成改廁目標，缺乏對家庭改廁的技術培訓，“重建設，輕宣教”的問題廣泛存在，導致廣一大農民對建設衛生廁所的意義、衛生廁所工作原理、技術要點、維護方式等問題缺乏了解。衛生廁所建成后，用戶沒有足夠的知識和能力正確使用和維護它，使衛生廁所的使用壽命縮短，衛生效果下降。主要問題有兩方面：

   ，家庭不能正確清掏和處理糞便，影響廁所的衛生效果。包括三格化糞池式衛生廁所在內的化廁所的設計初衷是結合我國農村使用糞肥的傳統，同時解決糞便貯存和處理問題，使糞便符合化衛生要求，這不僅糞便帶來的衛生問題，還為農業耕作提供   肥料。過去，糞肥是我國農業重要的肥料來源，   多地糞肥利用率超過，隨著北京市農村耕地減少和化肥的普及，糞肥在農業中的重要性逐漸下降，越來越多的家庭不再使用糞肥，超過一半的家庭現己選擇雇傭吸糞車清理糞便。很多家庭不了解三格化糞池的工作原理，也沒有糞便化的概念，在清掏糞便時為了方便要求吸糞車將化糞池三格一并清空，一些家庭在改建廁所時，甚至直接將三格化糞池改為一格大化糞池，新舊糞便混合在一起，清理時糞便無法達到化。三格化糞池廁所建設方式錯誤、糞便清掏方式不當等相似情況。目前尚缺乏對吸糞車的統一管理，收集的未經化處理的糞便往往被直接用于施肥或排放到自然環境，造成環境污染和傳染病風險。

第。，使用者采用錯誤的方式應對廁所冬季凍結的問題，降低了改廁效益效果。當初開展改廁活動時大部分農村衛生廁所建在院內，沒有保溫取暖設施。北京市冬季寒冷，特別是北部山區，根據2015-2016年氣溫記錄，延慶   低溫度可達一24℃，密云和平谷可達一2℃廁室內溫度低導致便器結冰無法沖水，造成使用不便。部分家庭在冬季停用衛生廁所，在衛生廁所旁邊另挖一個早廁，此現象在北部的延慶和密云較為常見。冬季使用旱廁雖不會孽生蚊蠅，但廁所糞液滲漏和和暴露仍會對環境造成   的污染，也導致觀感較差。一些村民使用熱水沖廁的方式，造成便器炸裂；部分村民在高壓水沖裝置凍結時大力猛踩，造成彈簧和腳踏桿折斷。由于沒有就使用中可能遇到的問題對使用者進行充分指導和培訓，影響了廁所的使用壽命。通過改建為室內衛生間，可以較好解決冬季廁所凍結問

題；有的家庭采用儲水桶深埋、做好廁所保暖措施的方式，也取得較好的防凍效果。